כמובן שההפניה תגיע גם ממחלקות המרכז לבריאות הנפש עצמו, לגבי כול חולה המשתחרר ואזור השייכות מרפאתית, שייך למרפאה זו. גם חולה אשר נבדק בחדר המיון, ולא נמצאה הצדקה לאשפוזו, יכול להיות מופנה בהמלצה לטיפול מרפאתי. 
אדם הפונה למרפאתנו מתקבל להערכה ראשונית הכוללת הערכה על רצף ביו- פסיכו- סוציאלי. הכוונה היא להתייחסות להיבט הביולוגי-כלומר מחלות רקע, בעיות אורגניות גופניות, פסיכולוגיות, כלומר אותם מרכיבים נפשיים המהווים את המוקד היחודי לפנייתו, והחלקים הסוציאליים, הווה אומר חברתיים, סביבתיים ומשפחתיים אשר משפעים ביותר על החלק הנפשי, על התפקוד, היכולת החברתית והזוגית, ועל השיקום  העתידי שלו, כולל מיצוי זכויותיו מול הרשויות.